Уважаемые читатели, у нас есть интересные новости для вас! Наш специальный выпуск содержит интересную информацию о нашем тесте А-локуса, который мы сейчас обновили. С помощью этого нового метода мы теперь также можем различать затушеванный соболь и чистый соболь, а также черно-подпалый и седло-подпалый. Мы надеемся, что вам понравится наш информационный бюллетень, и желаем вам приятного чтения!
Новости: Тестовый анализ локуса А был изменен 01 мая 2023 г. Предыдущий генетический тест на А-локус (ASIP) позволял различать аллели: Ay, Aw, at и a. Аллель Ay соответствует доминантному желтому окрасу (палевому/соболиному), аллель Aw – дикому окрасу (агути), аллель at – черно-подпалому окрасу и аллель a – рецессивному черному окрасу. При «классическом» анализе невозможно было различить, имеет ли доминантная желтая собака темные кончики шерсти (так называемый «затушеванный соболь») или нет («чисто-соболь»). Также было невозможно определить, была ли собака с генотипом at/at (или at/a) черно-подпалой или седло-подпалой.
Более поздний тест, основанный на результатах международной группы исследователей, идентифицирует различные так называемые промоторы в области гена ASIP, что позволяет провести более точный анализ по сравнению с предыдущим тестом. Новый тест может различать следующие гаплотипы: Желтый без черных кончиков волос (доминирующий желтый, DY) Желтый с темными кончиками волос (затененный желтый, SY) Дикие окрасы (агути, AG) Седло-рыжий (черное седло, BS) Черно-подпалый (черная спина, ВВ) Рецессивный черный Тест обнаруживает варианты как для так называемых «вентральных промоторов» (VP), так и для «промоторов цикла роста волос» (HCP). ВП контролируют распространение эумеланина (темного пигмента) по всему телу собаки. HCP контролируют распространение эумеланина вдоль отдельных стержней волос.
Новый тест различает два разных варианта VP (VP1 и VP2) и пять разных вариантов HCP (HCP1, HCP2, HCP3, HCP4 и HCP5). В зависимости от того, какой VP и какой HCP расположен на хромосоме в каждом отдельном случае (в так называемом гаплотипе), этому гаплотипу присваивают обозначения DY, SY, AG, BS или BB. Анализ рецессивного черного (генотип а/а) не изменился и тестируется и определяется как прежде.
Новая система тестирования приводит к следующим возможным комбинациям «новых» гаплотипов: Таблица 1: Новые аллели всегда состоят из комбинации VP с HCP. В следующей таблице показано сравнение предыдущих аллелей с новыми гаплотипами и улучшенная дифференциация, возможная с помощью нового теста: Таблица 2 С помощью нового анализа сомнительные случаи с обычными результатами теста на А-локус, такие как черно-подпалые собаки с генотипом Aw/Aw, которые иногда встречались у бордер-колли, цвергшнауцеров, пуделей и нордических пород, теперь тоже можно объяснить.
Кроме того, с помощью новых данных можно отличить черно-подпалый (B/B) и седло-подпалый (BS), а также светло-соболиный (DY) и затушеванный соболиный (SY) окрасы.
Однако фактический окрас шерсти собаки определяется не только генетикой А-локуса, но и всегда является результатом взаимодействия всех генных локусов, касающихся окраса шерсти. Например, собака должна иметь генотип ky/ky в локусе К, чтобы обеспечить полное выражение генетики локуса А. E-локус с его многочисленными возможными генетическими вариантами (например, e1, eA, например) также может влиять на удлинение эумеланина и, таким образом, модифицировать фенотипы, определяемые A- и K-локусами.
И . Баннаш, Д.Л., Келин, К.Б., Летко, А., Лехель, Р., Хуг, П., Джаганнатан, В., Хенкель, Дж., Русье, П., Хитонен, М.К., Лохи, Х., Арумилли, М., Консорциум DoGA, Майнор, К.М., Микельсон, Дж.Р., Дрёгенмюллер, К., Барш, Г.С., Либ, Т. Окрас собак, объясненный модульными промоутерами древнего собачьего происхождения. Nat Ecol Evol 5, 1415–1423 (2021). doi: 10.1038/s41559-021-01524-x
Ч тобы задать вопросы или заказать генетические тесты, перейдите по ссылке
https://shop.labogen.com/en/. Если у вас есть дополнительные вопросы, пожалуйста, не стесняйтесь обращаться к команде Labogen по электронной почте
labogen@laboklin.com или по телефону +49 971 / 72 02 505. Мы надеемся, что вам понравился информационный бюллетень. Пожалуйста, дайте нам знать, что вы думаете об этом, а тем временем мы готовим для вас наш следующий выпуск. Ваша команда Лабоген
Текст: здесь
Dear readers, we have interesting news for you! Our special issue contains interesting information about our A-locus test which we now have updated. With this new method we can now also distinguish between shaded sable and clear sable as well as black and tan and saddle tan. We hope you enjoy our newsletter and wish you a pleasant read! News: The test analysis of the A-locus has been changed on 01 May 2023 The previous genetic test for the A-locus (ASIP) could differentiate between the alleles: Ay, Aw, at and a. The allele Ay stood for dominant yellow (fawn/sable), the allele Aw for wild colours (agouti), the allele at for black and tan and the allele a for recessive black. With the "classic" analysis it was not possible to distinguish whether a dominant yellow dog has dark hair tips (so-called "shaded sable") or not ("clear sable"). It was also not possible to distinguish whether a dog with the genotype at/at (or at/a) was black and tan or saddle tan. A more recent test, based on the results of an international group of researchers, identifies various so-called promoters in the area of the ASIP gene, which allows a more precise analysis compared to the previous test. The new test can differentiate between the following haplotypes: Yellow without black hair tips (dominant yellow, DY) Yellow with dark hair tips (shaded yellow, SY) Wild colours (agouti, AG) Saddle tan (black saddle, BS) Black and tan (black back, BB) Recessive black The test detects variants for both the so-called "ventral promoters" (VP) and "hair cycle promoters" (HCP). The VP control the expansion of eumelanin (dark pigment) over the dog’s entire body. The HCPs control the expansion of eumelanin along the individual hair shafts. The new test differentiates between two different VP variants (VP1 and VP2) and five different HCP variants (HCP1, HCP2, HCP3, HCP4 and HCP5). Depending on which VP and which HCP is located on a chromosome in each individual case (in the so-called haplotype), this haplotype is associated with the designations DY, SY, AG, BS or BB. The analysis of recessive black (genotype a/a) has not changed and is tested and determined as before. The new testing system leads to the following possible combinations of the "new" haplotypes: Table 1: The new alleles are always composed of the combination of a VP with an HCP. The following table shows the comparison of the previous alleles with the new haplotypes and the improved differentiation that is possible with the new test: Table 2 With the help of the new analysis, questionable cases with the conventional results of the A-locus test, such as black and tan coloured dogs with the genotype Aw/Aw, which occasionally occurred in Border Collies, Miniature Schnauzers, Poodles and Nordic breeds, can now be explained as well. In addition, with the help of the new findings, black and tan (B/B) and saddle tan (BS) as well as clear sable (DY) and shaded sable (SY) can be differentiated from each other. However, as the actual coat colour of a dog is not only determined by the genetics on the A-locus, but it is always the result of the interaction of all gene loci regarding coat colours. For example, a dog must have the ky/ky genotype at the K-locus to enable a full expression of the A-locus genetics. The E-locus with its many possible genetic variants (e.g. e1, eA, eg) can also influence the extension of eumelanin and thus modify the phenotypes determined by the A- and K-loci. I Bannasch, D.L., Kaelin, C.B., Letko, A., Loechel, R., Hug, P., Jagannathan, V., Henkel, J., Roosje, P., Hytönen, M.K., Lohi, H., Arumilli, M., DoGA consortium, Minor, K.M., Mickelson, J.R., Drögenmüller, C., Barsh, G.S., Leeb, T. Dog colour patterns explained by modular promoters of ancient canid origin. Nat Ecol Evol 5, 1415–1423 (2021). doi: 10.1038/s41559-021-01524-x For enquiries or ordering genetic tests, please go to the
https://shop.labogen.com/en/. If you have any further questions, please do not hesitate to contact the Labogen team by e-mail at
labogen@laboklin.com or by phone +49 971 / 72 02 505. We hope you liked the newsletter. Please let us know what you think about it and in the meantime, we are preparing our next issue for you. Your Labogen team
Вход
Регистрация
БАЗА РОДОСЛОВНЫХ
ГАЛЕРЕЯ
FAQ
